For at kunne deltage som patientforning på selve Sundhedsdagen skal foreningen have en lokalafdeling i Roskilde Amt og kunne stille med hjælpere på selve dagen. Derudover skal man deltage i et par informationsmøder i den indledende fase af planlægningen af Sundhedsdagen. Udover patientforeningerne deltager Roskilde Amts sundhedsafdeling, Roskilde Amts forbyggelsesafdeling Roskilde Amtssygehus køkkenafdeling, Lægekredsforeningen for Roskilde Amt, Danske Fysioterapeuter.

Sundhedsdagen er bygget op omkring forskellige aktiviteter på Hestetorvet og på Dom Apoteket. Hestetorvet ligger lige bag ved apoteket og der holder alle patientforeningerne og de andre deltagere til med deres telte. Selve dagen starter med at amtsborgmester Kristian Ebbensgaard åbner dagen. De tidligere år har bla. de forskellige sundhedsministre åbnet dagen, og sundhedsminister Carsten Koch åbnede Sundhedsdagen 1999. Efter den officielle åbning er foretaget er der mulighed for at besøge de mange telte på Hestetorvet, deltage i Sundhedsløbet, deltage i cykelløbet, besøge politikerteltet eller høre debat som ligeledes foregår i Amtets telt efter politikerdebatten, dagen afsluttes kl. 14.00 af borgmester Bjørn Dahl..

Politikerdebatten holdes i tidsrummet 10.30-12.00 og alle interesserede kan komme i dialog med lokale politikere i amtets telt. I år består panelet af Amtsborgmester Kristian Ebbensgaard, borgmester Bjørn Dahl og  sognepræst ved Jakobskirken Anne Margrethe Raabjerg Hvas med politisk redaktør ved TV2 Kaare R. Skou som ordstyrer. Paneldebatten har hvert år et tema og i 2006 er det " En sund sjæl i et sundt legeme", en debat om sundhed for sjæl og legeme. For at debatten skal være så livlig som mulig opfordres tilhørerne til at give sin mening til kende ved at stille spørgsmål til paneldeltagerne.

Når klokken er 12.00 overrækkes Danske Banks Roskilde Sundhedspris. Prisen er på kr. 20.000 kroner og tildeles en person, virksomhed, institution eller forening i Roskilde-området, der gennem en uselvisk indsats har gjort noget særligt for sundheden. Prisen overrækkes af amtsborgmesteren og direktøren for Danske Bank.

Ligeledes er der også et Sundhedsløb, som strækker sig over 2 distancer på henholdsvis 2,5 og 5 km, hvor man kan gå eller løbe distancen. Tilmeldingen til løbet sker ved at udfylde en tilmeldingskupon som enten fåes på Dom Apoteket, fra Sundhedsavisen eller på selve dagen i løbsteltet eller i informationsteltet. Løbet starter med en fælles opvarmning kl 12. 10 og derefter starter selve løbet kl. 12.25. Løbet slutter kl. 13.35, hvorefter der vil blive trukket lod om spændende præmier til de deltagere som gennemfører løbet, hvor blandt andet en af præmierne er et gavekort på kr. 700,00 til sportstøj.

Igen i år arrangeres der cykelløb fra Hestetorvet til Gundsø Rådhus og tilbage igen ca. 25 km under ledelse af Reno B. Olsen og Hans Henrik Ørsted.  Amtsborgmester og borgmester sætter cykelløbet i gang. Blandt deltagerne, der gemmefører løbet,  vil der blive trukket lod om en gavekort på kr. 700,00 til sportstøj. Præmien annonceres kl. 14.00 på Hestetorvet.

I forbindelse med Sundhedsdagen vil der blive udgivet en Sundhedsavis. Avisen vil blive udsendt en uge før Sundhedsdagen afvikles og husstandsomdeles via Post Danmark(BT-format). Avisen, som vil blive på 24 sider, bliver husstandsomdelt i 60.000 eksemplarer i hele Roskilde Avis´s distributionsområde. Selve avisen har indlæg fra Roskildes borgmester og amtsborgmester og en midterside med dagens program. På denne midterside vil der ud over programmet være tilmeldingskupon til sundhedsløbet, sundhedsattest og Tip en 13´er, hvor der blandt de rigtige løsninger trækkes lod om en kasse med 3 flasker god rødvin. Vinderen annonceres kl. 14.00 på Hestetorvet. Derudover har hver patientforening et redaktionelt indlæg til Sundhedsavisen.